上海黑车的管理部门主要是 上海城市交通执法大队。根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十四条规定，未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营的，由县级以上道路运输管理机构责令停止经营；有违法所得的，没收违法所得，处违法所得2倍以上10倍以下的罚款；没有违法所得或者违法所得不足2万元的，处3万元以上10万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
此外，虽然存在关于车管所、公安交管局以及交警参与黑车管理的信息，但这些部门主要是负责黑车的日常监管和执法，而上海城市交通执法大队则专注于打击非法营运行为，包括黑车。
