摩托车更换发动机需要遵循以下步骤和注意事项：
申请更换发动机
车主需要携带身份证、车辆行驶证、机动车登记证、新发动机合格证到车管所办理变更手续。
在车管所，车主需要申请验车，并留下新发动机号的拓片。
车辆检查
车辆检验过程中，车辆需要在检验场排队，不需要填写各种表格，只需在检验场排队检验即可。普通人不允许进入检测线，包括车主。车辆由工作人员驾驶，车主在出口等待。
办理手续并颁发新的驾驶执照
车辆检验完成后，车辆检验场会重新密封之前交给车主的信封，并给车主一份检验证明。然后，车主需要办理新的驾驶执照。
备案登记
摩托车更换发动机需要向登记该机动车的公安机关交通管理部门备案。根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第六条，更换发动机的，机动车所有人应当向登记该机动车的公安机关交通管理部门申请变更登记。
携带相关证明文件
申请机动车变更登记，应当提交下列证明：机动车所有人的身份证明；机动车登记证书；机动车行驶证；机动车安全技术检验合格证明。
注意事项
更换发动机必须依法进行，私自更换发动机属于违法行为。
更换发动机后，需要重新登记备案，确保所有手续和证件都齐全。
总结来说，摩托车更换发动机需要到车管所办理变更手续，并通过公安机关交通管理部门备案。车主需要携带相关证明文件，并确保所有手续和证件都齐全且合法。
